1. Ábending: Ábending vatnslitapenna er að jafnaði kringlótt, en oddurinn á merkipenna er flatur, sem skiptist í trefjaodd og froðulaga odd.
2. Blek: Merki eru vatns-, olíu- og alkóhól-undirstaða, en vatnslitapennar hafa aðeins eina vatnsmiðaða tegund.
3. Litun: Vatnslitapennar geta ekki staflað litum, en merkimiðar geta staflað litum. Auðveldara er að lita merkimiða en vatnslitapennar.
4. Notkun: Kosturinn við vatnslitapenna er að hann hefur nóg vatn, liturinn er ríkur og bjartur og ókosturinn er sá að vatnið er ójafnt, umskiptin eru óeðlileg og ekki auðvelt að samræma tvo litina saman, svo það er almennt hentugt fyrir barnamálverk og getur einnig verið notað sem merki.
Kosturinn við merkið er að vatnið er einsleitt og ókosturinn er sá að litaskilningurinn er veikari, en hægt er að samræma þetta tvennt vel saman og geta teiknað byggingarlistar og iðnaðarhönnunarmyndir.
